Jan-Erik Hybertsen har siden 2010 arbeidet regelmessig med flere av landets orkestre og forsvarskorps som Stavanger Symfoniorkester, Kongelige Norske Marines Musikkorps og Luftforsvarets Musikkorps. Han har også dirigert konserter med Nasjonaloperaen i Romania og Nasjonalfilharmonien i Moldova og arbeidet med Prinsens Musikkorps i Danmark.
Hybertsen er utdannet dirigent fra Norges Musikkhøgskole hvor han studerte med Ole Kristian Ruud, og han avla sin diplomeksamen med Kringkastingsorkesteret i 2010. Etter endt utdanning har han deltatt på flere masterclasser med ledende dirigenter som Eivind Gullberg Jensen, Stefan Solyom og Jorma Panula. I 2011/2012 var Kurt Masur en viktig inspirasjon for Hybertsen da han studerte med legenden ved mesterklasser i Tyskland og New York.
Han har også deltatt på dirigentverkstedet INTERAKTION i Berlin hvor han fikk muligheten til å arbeide med musikere fra Berliner Philharmoniker, Staatskapelle Berlin og Konzerthausorkester. Hybertsen har også studert operadireksjon med Paolo Arrivabeni ved Opera Royal de Wallonie.
I mai 2016 var Hybertsen finalist på stillingen som assistentdirigent ved Royal Scottish National Orchestra.